Muzeum znajduje się w punkcie Mierzei Kurońskiej najbardziej wysuniętym na północ – w Kopgalis, gdzie kończy się półwysep Mierzei Kurońskiej o długości 98 km i rozpoczyna się port w Kłajpedzie. Muzeum gromadzi, przechowuje, bada, konserwuje i upowszechnia wiedzę o wartościach muzealnych ukazujących historię żeglugi Litwy jako kraju morskiego oraz różnorodność morskiej przyrody.
